Enti con stessa partita iva ma con diverse denominazioni

E possibile gestire piu' Enti aventi la stessa partita iva.Mi spiego meglio
Enti quali per esempio CNR, Universita' etc hanno diverse denominazioni , come per esempio Università degli studi etc Dipartimento di Scienze ambientali etc oppure Universita degli studi etc Dipartimento di fisica e cosi via, quando si fattura a questi enti la fattura la si indirizza al Dipartimento che ne ha fatto richiesta e la partita iva è la stessa.
Ready pero' dice che esiste gia' un soggetto che ha tale partita iva e non permette di salvare.
Come si puo' fare ?