Importazione fatture vendita

Buongiorno,
ho un problema con l'importazione del file delle fatture di vendita tramite Team System, Vi spiego meglio:
Quando vado a contabilizzarmi la fattura di vendita in automatico mi fa la scrittura:
Crediti v/clienti  D
Merci c/vendite  A
Iva su vendite   A

Però a volte se ci sono delle spese di trasporto o bancarie, in questo caso mi vado a sbloccare la scrittura e modifico l'importo del conto merci c/vendite e aggiungo il relativo conto.
Notando bene, quando vado ad importare il file al mio commercialista, per le fatture che io ho modificato rimane sempre la scrittura che mi fa in automatico.
Vorrei sapere se esiste la possibilità di inviare il file nel modo in cui modifico io.
Non se sono stata abbastanza chiara, Resto in attesa di un riscontro.
Cordiali Saluti

Sabina